胶原酶（Collagenase）是一种蛋白酶，是唯一一种可以降解具有三股超螺旋结构的天然胶原纤维的蛋白酶，一般分为 I、II、III、IV 型、V 型胶原酶，可用于不同细胞组织的制备；分散酶II（DispaseII）也称中性蛋白酶II，用于从不同组织或器官中消化细胞外基质，释放并制备原代单细胞，也用于细胞培养中的细胞收获或接种转移，还可以用来防止悬浮细胞培养时的细胞意外结团；弹性蛋白酶是一组丝氨酸蛋白酶，不仅能裂解重要的结缔组织蛋白弹性蛋白，还能促进纤连蛋白等细胞外基质的降解，常用来解离含有大量细胞间纤维网络的细胞及组织，通常与胶原酶、胰蛋白酶等一起使用；嗜热菌蛋白酶，常用于肠上皮细胞的解离与消化；弹性蛋白酶(Elastase)通过作用于弹性蛋白的肽键、酰胺键和酯键将其水解，常与胰蛋白酶和胶原酶等联合使用，用于分离结缔组织和含有大量细胞网状纤维的组织。透明质酸酶(Hyaluronidase)通过随机降解透明质酸的β-N-乙酰己糖胺-[1-4]糖苷键，从而降低透明质酸的活性，常与胶原酶等联合使用，用于结缔组织的分离；脱氧核糖核酸酶Ⅰ(DeoxyribonucleaseⅠ, DNaseⅠ)作用于细胞分离降解出的DNA，防止DNA导致的细胞凝集，对细胞完整性无破坏作用。通常配合胶原酶或透明质酸酶等联合使用，不会单独使用。